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研究目標

破解 DNA 密碼的圖像

破解 DNA 密碼

使用電腦科學方法來解讀 DNA 序列,了解 DNA 如何影響生物的發育、功能、成長和繁殖

了解演化的圖像

了解演化

比較物種的差異,探索生命起源,推測演化過程,並了解遺傳病的成因

精準醫療的圖像

精準醫療

根據病人的 DNA 特徵進行疾病預防、診斷和治療的臨床決策

研究數據

DNA 序列數據可以從醫院、公司或是網路上的公共資料庫中獲取

定序機器可以檢測並記錄DNA資訊,供電腦分析,但其功能仍有局限性

30x

複製的樣本

0.25%

錯誤資訊的量

9M+

小片段

90GB+

人類資料大小

基因組裝圖片

使用的技術

想像一下,將 30 張相同的照片撕成總共 900 萬塊,有 0.25% 的損壞,並嘗試拼湊出完整的一張圖片

然後,在多張不同的照片中,找到相似或有差異的部分,還有需要特別關注的區塊

這個困難的問題,需要許多人共同努力來解決

  • 程式設計
  • 演算法
  • 大數據
  • 資料結構
  • 觀察
  • 學習
  • 分析
  • 思考
  • 邏輯
  • 表達
  • 合作
  • 執行

教授

黃耀廷教授的照片

黃耀廷

教育背景 :
  • 博士,台灣大學 資訊工程學系 (2003 ~ 2006)
  • 碩士,台灣大學 資訊工程學系 (2001 ~ 2003)
  • 學士,交通大學 資訊工程學系 (1997 ~ 2001)
專業經歷 :
  • 教授,中正大學 資訊工程學系 (2018/8 ~)
  • 副教授,中正大學 資訊工程學系 (2012/8 ~ 2018/7)
  • 助理教授,中正大學 資訊工程學系 (2007/8 ~ 2012/7)
  • 博士後研究員,中研院 基因體中心 (2006/8 ~ 2007/7)
  • 理監事,TGGS.org.tw (2017 ~ 2023)
  • 理監事,TPHTG.org (2022 ~ 2023)
  • 副主編,JISE (2020 ~ 2023)
研究興趣 :

我們利用 NGS/TGS 研究傳染病,並開發算法/軟體,並在頂級期刊如《Genome Research》、《Genome Biology》和《Bioinformatics》發表論文

歡迎有興趣的學生加入我們的團隊

實驗室 成員

2025
林柏宇的照片

林柏宇

助教碩士
Email:paulboul1013@gmail.com
李承恩的照片

李承恩

學士
張鈞婷的照片

張鈞婷

學士
陳秉庭的照片

陳秉庭

助教碩士
Email:rosedog0328@gmail.com
吳昱承的照片

吳昱承

學士
鐘元廷的照片

鐘元廷

學士
楊詠荏的照片

楊詠荏

助教碩士
Email:blackrock88426@gmail.com
2024
符絮棻的照片

符絮棻

助教碩士校友
Email:fushufen9125@gmail.com
姜懷翔的照片

姜懷翔

助教碩士校友
Email:c109110123@nkust.edu.tw
廖子游的照片

廖子游

助教碩士學士校友
Email:liaoyoyo2001@gmail.com

實驗室 活動

畢業流水席 封面

畢業流水席

在系館前席開流水席,歡送實驗室畢業的學長姐。

2026-06-06
聚餐 封面

聚餐

實驗室學長姐聚餐,一起舉杯敘舊。

2026-05-02
運動會 封面

運動會

實驗室運動會,排球、籃球與撞球輪番上陣。

2026-01-31
實驗室聚餐 封面

實驗室聚餐

例行實驗室聚餐。

2026-01-29
香港實驗室討論 封面

香港實驗室討論

與香港大學羅教授實驗室進行研究討論,並參加 GIW/ISCB-Asia 研討會,也走訪香港認識在地文化。

2025-12-10
參加研討會 封面

參加研討會

參加 TGGS 研討會,進行海報發表並與各校研究團隊交流。

2025-12-05
實驗室聚餐 封面

實驗室聚餐

實驗室聚餐

2025-08-21
實驗室休閒活動排程 封面

實驗室休閒活動排程

實驗室休閒活動排程

2025-07-31
教授和畢業學長合照 封面

教授和畢業學長合照

教授和畢業學長合照

2025-06-26
聚餐和桌遊 封面

聚餐和桌遊

團體聚餐和玩桌遊

2025-05-03
畢業聚餐 封面

畢業聚餐

實驗室聚餐

2025-01-22
團體運動 封面

團體運動

實驗室團體運動

2025-01-18
參加研討會 封面

參加研討會

參加研討會

2024-12-14
學長姐聚餐 封面

學長姐聚餐

學長姐聚餐

2024-10-27
大林卡丁車運動 封面

大林卡丁車運動

體驗卡丁車運動的樂趣

2024-09-09
民雄鵝肉聚餐 封面

民雄鵝肉聚餐

畢業聚會,吃民雄著名的鵝肉飯

2024-07-16
學長姐畢業照 封面

學長姐畢業照

畢業合照

2024-06-20
涮乃葉尾牙 封面

涮乃葉尾牙

實驗室運動後聚餐

2024-01-25
實驗室運動會 封面

實驗室運動會

驗收每周運動的成果,兩隊運動比賽

2024-01-24

實驗室 常見問題

什麼是生物資訊?

  • 凡是解決所有生命科學的問題,但採用電腦科學的方法,皆可納入此範疇。 近年來由於生物學家發明了各種基因檢測晶片、高速DNA定序儀,產生大量的DNA資料, 然而每個人DNA約有30億個核苷酸(A,C,G,T),必須藉由電腦的高速計算與軟體分析, 以期能解開各種生命現象的謎團

生物資訊有什麼應用?

  • 透過軟體設計來分析DNA,可以擷取出隱藏在DNA中的複雜遺傳資訊, 提早檢測你我是否帶有遺傳性疾病(例如,癌症、糖尿病)、降低器官排斥之風險、或協助開發新藥物等。 此外,DNA還可以協助演化學家解開各種物種間的演化歷史,偵測是否有物種受到達爾文進化論之影響

我需要具備生物知識嗎?

  • 不需要。本實驗室成員皆為資訊背景,但我們、Wikipedia、與Google會教你基本的DNA常識

我適合從事跨領域研究嗎?

  • 生物資訊橫跨生命科學與電腦科學領域。因此該領域較適合個性上有好奇心者,對於未知的生命現象, 不同領域之角度,與不同領域之方法,會有興趣去學習與瞭解者

貴實驗室都在做什麼研究?

  • 本實驗室目前專注於數種DNA檢測晶片的分析、DNA高速定序資料之處理、與跨物種間的演化研究
線上期刊

這是一份包含:同行評審文章、生物資訊學和計算生物學的科學期刊列表

教學文件

長讀癌症基因體學入門教材,包含互動圖解與實作教學

程式碼

實驗室近期專注研究與開發的程式,可以從 GitHub 上查看

檔案下載

這裡包含了一些公開的生物資訊測試數據,有些檔案已經經過前處裡過