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研究目標

破解 DNA 密碼的圖像

破解 DNA 密碼

使用電腦科學方法來解讀 DNA 序列，了解 DNA 如何影響生物的發育、功能、成長和繁殖

了解演化的圖像

了解演化

比較物種的差異，探索生命起源，推測演化過程，並了解遺傳病的成因

精準醫療的圖像

精準醫療

根據病人的 DNA 特徵進行疾病預防、診斷和治療的臨床決策

研究數據

DNA 序列數據可以從醫院、公司或是網路上的公共資料庫中獲取

定序機器可以檢測並記錄DNA資訊，供電腦分析，但其功能仍有局限性

30x

複製的樣本

0.25%

錯誤資訊的量

9M+

小片段

90GB+

人類資料大小

基因組裝圖片

使用的技術

想像一下，將 30 張相同的照片撕成總共 900 萬塊，有 0.25% 的損壞，並嘗試拼湊出完整的一張圖片

然後，在多張不同的照片中，找到相似或有差異的部分，還有需要特別關注的區塊

這個困難的問題，需要許多人共同努力來解決

  • 程式設計
  • 演算法
  • 大數據
  • 資料結構
  • 觀察
  • 學習
  • 分析
  • 思考
  • 邏輯
  • 表達
  • 合作
  • 執行

教授

黃耀廷教授的照片

黃耀廷

職稱 :
教育背景 :
  • 博士，台灣大學 資訊工程學系 (2003 ~ 2006)
  • 碩士，台灣大學 資訊工程學系 (2001 ~ 2003)
  • 學士，交通大學 資訊工程學系 (1997 ~ 2001)
專業經歷 :
  • 教授，中正大學 資訊工程學系 (2018/8 ~)
  • 副教授，中正大學 資訊工程學系 (2012/8 ~ 2018/7)
  • 助理教授，中正大學 資訊工程學系 (2007/8 ~ 2012/7)
  • 博士後研究員，中研院 基因體中心 (2006/8 ~ 2007/7)
  • 理監事，TGGS.org.tw (2017 ~ 2023)
  • 理監事，TPHTG.org (2022 ~ 2023)
  • 副主編，JISE (2020 ~ 2023)
研究興趣 :

我們利用 NGS/TGS 研究傳染病，並開發算法/軟體，並在頂級期刊如《Genome Research》、《Genome Biology》和《Bioinformatics》發表論文

歡迎有興趣的學生加入我們的團隊

實驗室 成員

2024
廖子游的照片

廖子游

助教 碩士 學士
Email：liaoyoyo2001@gmail.com
符絮棻的照片

符絮棻

助教 碩士
Email：fushufen9125@gmail.com
姜懷翔的照片

姜懷翔

助教 碩士
Email：c109110123@nkust.edu.tw
2023
陳振裕的照片

陳振裕

碩士
Email：puddingchenk@gmail.com
黃柏鐘的照片

黃柏鐘

碩士
Email：benson10120@gmail.com
何明恩的照片

何明恩

碩士
Email：ianho7236@gmail.com
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林品翰

碩士
Email：hank06023@gmail.com
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謝鎮羽

學士
Email：e0979083123@gmail.com
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郭佑

學士
Email：youkuo2003@gmail.com
金辰翰的照片

金辰翰

學士
Email：hank9185@icloud.com
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學長姐聚餐

金韓食

學長姐聚餐

2024-10-27

大林卡丁車運動

大林小型賽車場

體驗卡丁車運動的樂趣

2024-09-09

民雄鵝肉聚餐

正宗民雄鵝肉亭

畢業聚會，吃民雄著名的鵝肉飯

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涮乃葉

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驗收每周運動的成果，兩隊運動比賽

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觀音瀑布

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組成「不耀廷」隊伍參加路跑活動

2023-03-19

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陶板屋

2023-01-16

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竹居茶樓

歡送外國交換生

2022-09-29
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實驗室 常見問題

什麼是生物資訊？

  • 凡是解決所有生命科學的問題，但採用電腦科學的方法，皆可納入此範疇。 近年來由於生物學家發明了各種基因檢測晶片、高速DNA定序儀，產生大量的DNA資料， 然而每個人DNA約有30億個核苷酸(A,C,G,T)，必須藉由電腦的高速計算與軟體分析， 以期能解開各種生命現象的謎團

生物資訊有什麼應用？

  • 透過軟體設計來分析DNA，可以擷取出隱藏在DNA中的複雜遺傳資訊， 提早檢測你我是否帶有遺傳性疾病(例如，癌症、糖尿病)、降低器官排斥之風險、或協助開發新藥物等。 此外，DNA還可以協助演化學家解開各種物種間的演化歷史，偵測是否有物種受到達爾文進化論之影響

我需要具備生物知識嗎？

  • 不需要。本實驗室成員皆為資訊背景，但我們、Wikipedia、與Google會教你基本的DNA常識

我適合從事跨領域研究嗎？

  • 生物資訊橫跨生命科學與電腦科學領域。因此該領域較適合個性上有好奇心者，對於未知的生命現象， 不同領域之角度，與不同領域之方法，會有興趣去學習與瞭解者

貴實驗室都在做什麼研究？

  • 本實驗室目前專注於數種DNA檢測晶片的分析、DNA高速定序資料之處理、與跨物種間的演化研究
線上期刊

這是一份包含：同行評審文章、生物資訊學和計算生物學的科學期刊列表

影片教程

生物資訊的教學影片，你可以從 YouTube 頻道中學習到生物資訊的基本知識

程式碼

實驗室近期專注研究與開發的程式，可以從 GitHub 上查看

檔案下載

這裡包含了一些公開的生物資訊測試數據，有些檔案已經經過前處裡過